Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms