Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Sycp2Q9CUU3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms