Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
4930535I16RikQ9CUI2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms