Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms