Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS42

Prps2, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prps2Q9CS42 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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