Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms