Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms