Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR00

Psmd9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd9Q9CR00 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmd9Q9CR00 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms