Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp5f1Q9CQQ7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp5f1Q9CQQ7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms