Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQF4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQF4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQF4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQF4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQF4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQF4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms