Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sar1bQ9CQC9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms