Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms