Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms