Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms