Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms