Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf17Q99MV7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms