Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms