Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed9Q99KF1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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