Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GatbQ99JT1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GatbQ99JT1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GatbQ99JT1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GatbQ99JT1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GatbQ99JT1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GatbQ99JT1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GatbQ99JT1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GatbQ99JT1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GatbQ99JT1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GatbQ99JT1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GatbQ99JT1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GatbQ99JT1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GatbQ99JT1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GatbQ99JT1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GatbQ99JT1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GatbQ99JT1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GatbQ99JT1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GatbQ99JT1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GatbQ99JT1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GatbQ99JT1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GatbQ99JT1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GatbQ99JT1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GatbQ99JT1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GatbQ99JT1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GatbQ99JT1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GatbQ99JT1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms