Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms