Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms