Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms