Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms