Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Afg3l1Q920A7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Afg3l1Q920A7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Afg3l1Q920A7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Afg3l1Q920A7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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