Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc49Q91YK0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms