Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms