Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd3Q91WC0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd3Q91WC0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd3Q91WC0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd3Q91WC0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd3Q91WC0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd3Q91WC0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd3Q91WC0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd3Q91WC0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd3Q91WC0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd3Q91WC0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd3Q91WC0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd3Q91WC0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd3Q91WC0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd3Q91WC0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd3Q91WC0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd3Q91WC0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd3Q91WC0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd3Q91WC0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd3Q91WC0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd3Q91WC0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd3Q91WC0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd3Q91WC0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms