Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NifkQ91VE6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NifkQ91VE6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NifkQ91VE6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NifkQ91VE6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NifkQ91VE6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NifkQ91VE6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NifkQ91VE6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NifkQ91VE6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NifkQ91VE6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NifkQ91VE6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NifkQ91VE6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NifkQ91VE6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NifkQ91VE6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NifkQ91VE6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NifkQ91VE6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NifkQ91VE6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NifkQ91VE6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NifkQ91VE6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NifkQ91VE6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NifkQ91VE6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NifkQ91VE6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NifkQ91VE6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NifkQ91VE6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NifkQ91VE6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms