Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms