Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp4Q8VHC5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp4Q8VHC5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp4Q8VHC5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp4Q8VHC5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp4Q8VHC5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp4Q8VHC5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp4Q8VHC5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp4Q8VHC5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms