Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDG5

Ppcs, Phosphopantothenate--cysteine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpcsQ8VDG5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PpcsQ8VDG5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PpcsQ8VDG5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PpcsQ8VDG5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PpcsQ8VDG5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PpcsQ8VDG5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PpcsQ8VDG5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PpcsQ8VDG5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PpcsQ8VDG5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PpcsQ8VDG5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PpcsQ8VDG5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PpcsQ8VDG5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PpcsQ8VDG5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PpcsQ8VDG5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PpcsQ8VDG5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PpcsQ8VDG5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PpcsQ8VDG5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PpcsQ8VDG5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PpcsQ8VDG5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PpcsQ8VDG5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PpcsQ8VDG5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PpcsQ8VDG5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PpcsQ8VDG5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PpcsQ8VDG5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PpcsQ8VDG5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PpcsQ8VDG5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PpcsQ8VDG5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PpcsQ8VDG5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PpcsQ8VDG5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PpcsQ8VDG5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PpcsQ8VDG5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PpcsQ8VDG5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PpcsQ8VDG5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PpcsQ8VDG5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PpcsQ8VDG5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms