Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCZ8

Rpusd1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd1Q8VCZ8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms