Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW6

Nae1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nae1Q8VBW6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms