Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1Q0

Stx19, Syntaxin-19, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx19Q8R1Q0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx19Q8R1Q0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms