Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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