Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hecw1Q8K4P8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms