Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms