Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scara5Q8K299 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scara5Q8K299 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scara5Q8K299 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scara5Q8K299 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scara5Q8K299 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scara5Q8K299 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scara5Q8K299 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scara5Q8K299 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Scara5Q8K299 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scara5Q8K299 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scara5Q8K299 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Scara5Q8K299 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scara5Q8K299 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scara5Q8K299 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scara5Q8K299 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Scara5Q8K299 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scara5Q8K299 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Scara5Q8K299 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scara5Q8K299 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scara5Q8K299 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scara5Q8K299 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scara5Q8K299 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scara5Q8K299 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms