Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms