Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms