Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pkn3Q8K045 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.1 ms