Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf628Q8CJ78 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms