Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms