Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mterf1aQ8CHZ9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms