Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI0

Nedd4l, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, mousemouse

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Length 1,004 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4lQ8CFI0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nedd4lQ8CFI0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nedd4lQ8CFI0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nedd4lQ8CFI0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nedd4lQ8CFI0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nedd4lQ8CFI0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nedd4lQ8CFI0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nedd4lQ8CFI0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nedd4lQ8CFI0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nedd4lQ8CFI0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nedd4lQ8CFI0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4lQ8CFI0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4lQ8CFI0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4lQ8CFI0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4lQ8CFI0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4lQ8CFI0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4lQ8CFI0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4lQ8CFI0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Nedd4lQ8CFI0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Nedd4lQ8CFI0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4lQ8CFI0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4lQ8CFI0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4lQ8CFI0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4lQ8CFI0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4lQ8CFI0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4lQ8CFI0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4lQ8CFI0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nedd4lQ8CFI0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nedd4lQ8CFI0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd4lQ8CFI0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd4lQ8CFI0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Nedd4lQ8CFI0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Nedd4lQ8CFI0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd4lQ8CFI0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd4lQ8CFI0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd4lQ8CFI0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd4lQ8CFI0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd4lQ8CFI0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd4lQ8CFI0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd4lQ8CFI0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd4lQ8CFI0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd4lQ8CFI0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd4lQ8CFI0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd4lQ8CFI0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd4lQ8CFI0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd4lQ8CFI0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd4lQ8CFI0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Nedd4lQ8CFI0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Nedd4lQ8CFI0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd4lQ8CFI0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Nedd4lQ8CFI0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Nedd4lQ8CFI0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd4lQ8CFI0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd4lQ8CFI0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Nedd4lQ8CFI0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nedd4lQ8CFI0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nedd4lQ8CFI0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nedd4lQ8CFI0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nedd4lQ8CFI0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nedd4lQ8CFI0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nedd4lQ8CFI0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nedd4lQ8CFI0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nedd4lQ8CFI0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nedd4lQ8CFI0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nedd4lQ8CFI0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nedd4lQ8CFI0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nedd4lQ8CFI0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nedd4lQ8CFI0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nedd4lQ8CFI0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nedd4lQ8CFI0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nedd4lQ8CFI0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Nedd4lQ8CFI0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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