Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Rdh13Q8CEE7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh13Q8CEE7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh13Q8CEE7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh13Q8CEE7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh13Q8CEE7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh13Q8CEE7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh13Q8CEE7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh13Q8CEE7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh13Q8CEE7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rdh13Q8CEE7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rdh13Q8CEE7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rdh13Q8CEE7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rdh13Q8CEE7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rdh13Q8CEE7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh13Q8CEE7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rdh13Q8CEE7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh13Q8CEE7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh13Q8CEE7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh13Q8CEE7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh13Q8CEE7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rdh13Q8CEE7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh13Q8CEE7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh13Q8CEE7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh13Q8CEE7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Rdh13Q8CEE7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rdh13Q8CEE7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms