Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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