Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynpoQ8CC35 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynpoQ8CC35 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynpoQ8CC35 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynpoQ8CC35 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynpoQ8CC35 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynpoQ8CC35 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynpoQ8CC35 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynpoQ8CC35 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynpoQ8CC35 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynpoQ8CC35 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynpoQ8CC35 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SynpoQ8CC35 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynpoQ8CC35 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynpoQ8CC35 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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