Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9C9

4930507D05Rik, RIKEN cDNA 4930507D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930507D05RikQ8C9C9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
4930507D05RikQ8C9C9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms