Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol7cQ8C6E1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol7cQ8C6E1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol7cQ8C6E1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol7cQ8C6E1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol7cQ8C6E1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol7cQ8C6E1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol7cQ8C6E1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol7cQ8C6E1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol7cQ8C6E1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol7cQ8C6E1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol7cQ8C6E1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol7cQ8C6E1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol7cQ8C6E1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol7cQ8C6E1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol7cQ8C6E1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol7cQ8C6E1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol7cQ8C6E1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol7cQ8C6E1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol7cQ8C6E1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol7cQ8C6E1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol7cQ8C6E1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol7cQ8C6E1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol7cQ8C6E1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol7cQ8C6E1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol7cQ8C6E1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol7cQ8C6E1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol7cQ8C6E1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol7cQ8C6E1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol7cQ8C6E1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol7cQ8C6E1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Apol7cQ8C6E1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Apol7cQ8C6E1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms